Atendiendo a las Convocatorias de la Secretaria de Investigación y Posgrado (SIP), se autorizaron 36 proyectos de investigación: 17 Multidisciplinarios y Transdisciplinarios de Investigación Científica y Desarrollo Tecnológico, 15 Proyectos de Investigación Científica y Desarrollo Tecnológico y cuatro Para la Innovación 2016.
El Centro inició el año 2017 con 12 proyectos de investigación en operación, financiados con recursos externos. Durante el año se autorizaron cuatro proyectos más, resultado de la participación en las convocatorias del Fondo Sectorial CONACYT-Secretaria de Energía–Sustentabilidad Energética; de Apoyos Complementarios para el establecimiento y consolidación de Laboratorios Nacionales; de Ciencia Básica CONACYT; y de Investigación en Fronteras de la Ciencia, y se concluyeron en este mismo periodo 7 proyectos, quedando 9 vigentes.